叶片：前者对生，叶尖圆，生长的较密实。而后者轮生，叶尖尖，稀疏。花：前者整体白色，群体花期。而后者浅绿色，花期6-7月份。生长环境：前者喜强光而后者强光会导致死亡。
一、叶片的区别
绿菊的叶片为掌状，颜色为绿色，对生，叶尖顶头较圆。整体看起来为团簇状，非常密实。而金鱼藻的叶片4-12的轮生，裂片为丝状或者丝状条形，先端有白色的软骨质，叶尖较尖，颜色也为绿色但是整体颜色不如绿菊鲜亮，无规则分枝生长，较稀疏。
二、花的区别
绿菊的花颜色为白色，外面一层花瓣白色，基部有点黄色，内瓣尖端为绿色，花态为飞舞状，整个花型呈复瓣形。群体花期，早点的6月10号就开始开花，长达65天。而金鱼藻的花颜色为浅绿色，先端带有3齿和紫色的毛，子房为卵形，花柱为钻形。花期在6-7月份。
三、生长环境的区别
绿菊适合在光线充足的环境下生长，喜欢强光照射，光线不太明朗的情况下会导致掉叶子停止生长。而金鱼藻虽然也喜欢光线，但是如果是强光照射会导致死亡，不明亮的光线倒是对它没影响，不会停止生长。
