微波炉纸盒子能加热，但不建议把纸质的东西直接放入微波炉中，因为纸质盒子不耐高温，如果使用微波炉加热没有控制好温度和时间，很容易出现危险事故。其次，纸质盒子被加热后变软，食物里可能会掺杂着一些纸质的成分，食用后可能导致人体不适。可以用专门的微波炉加热的玻璃碗或者瓷盘，这样更容易加热，也更安全。
微波炉加热的注意事项：
1、忌用普通塑料容器：一是热的食物会使塑料容器变形，二是普通塑料会放出有毒物质，污染食物，危害人体健康。
2、忌用金属器皿：因为放入炉内的铁、铝、不锈钢、搪瓷等器皿，微波炉在加热时会与之产生电火花并反射微波，既损伤炉体又不能加热食物。
3、忌使用封闭容器：加热液体时应使用广口容器，因为在封闭容器内食物加热产生的热量不容易散发，使容器内压力过高，易引起爆破事故。
4、忌用瓶颈窄小的瓶装食物：就算打开了盖亦因压力而膨胀，引致爆炸。
5、忌用半满开了盖的瓶装婴儿食物或原瓶放入炉内加热，以免瓶子破裂。
6、凡竹器、漆器等不耐热的容器，有凹凸状的玻璃制品，均不宜在微波炉中使用。
7、瓷制碗碟不能镶有金、银花边。 使用专门的微波炉器皿盛装食物放入微波炉中加热。
8、忌超时加热：食品放入微波炉解冻或加热，若忘记取出，如果时间超过2小时，则应丢掉不要，以免引起食物中毒。微波炉的加热时间要视材料及用量而定，还和食物新鲜程度、含水量有关。由于各种食物加热时间不一，故在不能肯定食物所需加热时间时，应以较短时间为宜，加热后可视食物的生熟程度再追加加热时间。否则，如时间太长，会使食物变得发硬，失去香、色、味，甚至产生毒素。按照食物的种类和烹饪要求，调节定时及功率（温度）旋钮，可以仔细阅读说明书，加以了解。
9、忌将肉类加热至半熟后再用微波炉加热：因为在半熟的食品中细菌仍会生长，第二次再用微波炉加热时，由于时间短，不可能将细菌全杀死。冰冻肉类食品须先在微波炉中解冻，然后再加热为熟食。
10、忌再冷冻经微波炉解冻过的肉类：因为肉类在微波炉中解冻后，实际上已将外面一层低温加热了，在此温度下细菌是可以繁殖的，虽再冷冻可使其繁殖停止，却不能将活菌杀死。已用微波炉解冻的肉类，如果再放入冰箱冷冻，必须加热至全熟。
11、忌油炸食品：因高温油会发生飞溅导致火灾。如万一不慎引起炉内起火时，切忌开门，而应先关闭电源，待火熄灭后再开门降温。
12、忌将微炉置于卧室，同时应注意不要用物品覆盖微波炉上的散热窗栅。
13、忌长时间在微波炉前工作：开启微炉后，人应远离微波炉或人距离微波炉至少在1米之外。
14、忌与其他电器共用同一插座，要用单一电源而且装接了地线的插座。
15、忌用微波炉暖婴儿的牛奶，因为牛奶热得不均匀时，容易灼伤婴儿。另外会使牛奶的营养成分破坏。
16、忌用微波炉去烘干衣服或者把硬化的指甲油煮软，以防起火。
17、忌徒手去移出微波炉内的食物。盛器及盖子加热后往往积聚了蒸气，又会吸收食物的热气，而变得十分烫手，应该用防热手套或垫子，以防灼伤。
18、不允许无含水食物放置微波炉内而使微波炉工作，这样会导致微波炉损坏。
