1、地面堆码贮藏：对于储藏室的选择可以选择没有直射光、空气流通的土质房子，在地面铺一层5cm厚稻草或麦秸。然后把老熟、无损伤南瓜堆上，尽量让南瓜挨着地面的方向向下，瓜蒂朝里瓜顶向外码成圆锥形。需要注意的是，每一堆的数量不要太多，控制在15到20个左右，防止挤压。在初期时要注意通风换气，保持室内空气新鲜、干燥和凉爽，到了冬季要关闭门窗，做好防寒工作。
2、架式分层贮藏：在储藏室内用竹木或角铁搭成分层贮藏架，在每层贮藏架上铺5cm厚稻草或麦秸，这种效果要好于地面堆码贮藏。
3、地窖低温贮藏：这种方式是非常好的，但是地窖的条件是很严格的，温度控制在10℃左右，相对湿度保持70%到80%。除此之外，储藏的南瓜要选择无损伤的南瓜，贮藏中要注意勤检查，挑出有损伤的南瓜，避免感染。
